Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS1P48651 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms