Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAPGP40121 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAPGP40121 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAPGP40121 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPGP40121 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms