Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZEB1P37275 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms