Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms