Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNA1P35221 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms