Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms