Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms