Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUSP1P28562 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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