Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB5P28074 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms