Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VARSP26640 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VARSP26640 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VARSP26640 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VARSP26640 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VARSP26640 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VARSP26640 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VARSP26640 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VARSP26640 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VARSP26640 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms