Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMA4P25789 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms