Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRPH2P23942 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRPH2P23942 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms