Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms