Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIG1P18858 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIG1P18858 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIG1P18858 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIG1P18858 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIG1P18858 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIG1P18858 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIG1P18858 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms