Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms