Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
XBP1P17861 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
XBP1P17861 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
XBP1P17861 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XBP1P17861 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms