Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms