Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPGDP15428 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms