Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms