Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFTRP13569 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFTRP13569 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFTRP13569 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFTRP13569 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFTRP13569 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFTRP13569 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CFTRP13569 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFTRP13569 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFTRP13569 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFTRP13569 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFTRP13569 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFTRP13569 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFTRP13569 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFTRP13569 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CFTRP13569 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms