Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms