Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms