Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3P10147 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms