Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI3P10071 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI3P10071 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms