Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3P09919 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms