Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms