Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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