Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL3P08700 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL3P08700 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms