Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA4P06727 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOA4P06727 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms