Protein–RNA interactions for Protein: P04920

SLC4A2, Anion exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A2P04920 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A2P04920 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A2P04920 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms