Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms