Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms