Protein–RNA interactions for Protein: O75494

SRSF10, Serine/arginine-rich splicing factor 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10O75494 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF10O75494 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms