Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms