Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN2BO60939 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms