Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM6AO15550 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms