Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRPO00591 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRPO00591 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRPO00591 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms