Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms