Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms