Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms