Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SDR42E2A6NKP2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms