Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms