Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED16Q9Y2X0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED16Q9Y2X0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms