Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POMPQ9Y244 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms