Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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