Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms