Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms