Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms