Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms