Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms